Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms