Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SphkapQ6NSW3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms