Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l2Q6KAU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l2Q6KAU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l2Q6KAU8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l2Q6KAU8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l2Q6KAU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg16l2Q6KAU8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg16l2Q6KAU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms