Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms