Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms