Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt77Q6IFZ6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms