Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Samd9lQ69Z37 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Samd9lQ69Z37 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms