Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CltcQ68FD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CltcQ68FD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms