Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprdQ64487 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprdQ64487 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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