Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gja3Q64448 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja3Q64448 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms