Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf4Q64310 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms