Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PatjQ63ZW7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms