Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms