Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20854Q62461 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms