Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx1Q62443 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms