Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim28Q62318 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim28Q62318 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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