Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock1Q62288 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms