Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms