Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1i1Q62219 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tgfb1i1Q62219 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms