Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssr4Q62186 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssr4Q62186 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms