Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3cQ62181 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms