Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt33bQ61897 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt33bQ61897 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms