Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Itga6Q61739 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga6Q61739 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms