Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fscn1Q61553 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn1Q61553 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fscn1Q61553 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms