Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox17Q61473 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox17Q61473 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms