Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccne1Q61457 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms