Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nell2Q61220 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nell2Q61220 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms