Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp4Q60972 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms