Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms