Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Neurod1Q60867 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Neurod1Q60867 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Neurod1Q60867 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Neurod1Q60867 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Neurod1Q60867 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Neurod1Q60867 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Neurod1Q60867 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms