Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasa3Q60790 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rasa3Q60790 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasa3Q60790 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms