Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csnk2a1Q60737 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms