Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyb561Q60720 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms