Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmelQ60696 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmelQ60696 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmelQ60696 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PmelQ60696 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmelQ60696 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms