Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprnQ60673 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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PtprnQ60673 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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PtprnQ60673 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PtprnQ60673 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PtprnQ60673 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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