Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a3Q5XF89 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms