Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc5a6Q5U4D8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms