Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scaf1Q5U4C3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms