Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rabl6Q5U3K5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabl6Q5U3K5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabl6Q5U3K5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms