Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Specc1Q5SXY1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms