Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brip1Q5SXJ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms