Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
NacadQ5SWP3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NacadQ5SWP3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms