Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms