Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Sco1Q5SUC9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Sco1Q5SUC9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Sco1Q5SUC9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Sco1Q5SUC9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Sco1Q5SUC9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Sco1Q5SUC9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sco1Q5SUC9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sco1Q5SUC9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sco1Q5SUC9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sco1Q5SUC9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sco1Q5SUC9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sco1Q5SUC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms