Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp18Q5SSI6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms