Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms