Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg7Q5RJH6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg7Q5RJH6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg7Q5RJH6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg7Q5RJH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg7Q5RJH6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg7Q5RJH6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg7Q5RJH6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms