Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlha9Q5RJB0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms