Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv4Q5R1A3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms