Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim41Q5NCC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Trim41Q5NCC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms